Vistas de página en el último mes

miércoles, 20 de septiembre de 2023

Paul Craig Roberts (15 de septiembre de 2023) Origen no natural del SARS-CoV-2 y sus variantes

 


https://www.paulcraigroberts.org/2023/09/15/unnatural-origins-of-covid-and-its-variants/


El 4 de septiembre informé de que científicos japoneses habían examinado el Covid y sus variantes y habían descubierto que todos son creaciones de laboratorio. https://www.paulcraigroberts.org/2023/09/04/japanese-scientists-find-that-covid-19-and-all-of-the-variants-are-laboratory-creations/


Este descubrimiento plantea la peligrosa e inquietante cuestión de por qué un laboratorio produce virus con los que infectar a los humanos.

Me puse en contacto con un científico que había participado en el estudio del SARS original para que evaluara y explicara el informe de los científicos japoneses. Su explicación figura a continuación. Es difícil de entender para los no profesionales, pero menos difícil que el estudio japonés original . Según entiendo los resultados, es la ausencia de mutaciones sinónimas en las variantes lo que revela que el Covid y sus variantes son creaciones de laboratorio.

Sospecho que el estudio japonés será suprimido y que cualquier científico estadounidense u occidental que se dedicara a esta investigación se encontraría con que se le retirarían los fondos de investigación y se pondría fin a su carrera.

Orígenes antinaturales del Covid y sus variantes

Doctor Marc G. Wathelet

El origen del SARS-CoV-2, el agente etiológico del COVID-19, sigue siendo controvertido más de 3 años después de su identificación. ¿Es este virus el producto de un acontecimiento zoonótico natural en un mercado de carne de Wuhan o procede de un laboratorio que trabaja con coronavirus? Estas dos hipótesis siguen sin resolverse, pero un reciente preprint arroja mucha luz sobre la cuestión y plantea algunos interrogantes inquietantes.

Este preprint "Unnaturalness in the evolution process of the SARS-CoV-2 variants and the possibility of deliberate natural selection"… https://zenodo.org/record/8216373 ), de Atsushi Tanaka y Takayuki Miyazawa, de la Universidad Médica y Farmacéutica de Osaka y de la Universidad de Kioto, fue escrito para científicos. He aquí un intento de hacer accesibles sus conclusiones a un público más amplio.

Su análisis de las variantes de Omicron les llevó a la conclusión de que "las formaciones de una parte de los aislados de Omicron BA.1, BA.1.1 y BA.2 no eran producto de la evolución del genoma, como suele observarse en la naturaleza". ¿Cómo llegaron a tan sorprendente conclusión? Empezaron su trabajo analizando la secuencia de la proteína Spike de varios aislados del virus.

Una proteína es una cadena de aminoácidos que se pliega en una estructura tridimensional y es la secuencia de aminoácidos en esa cadena y la forma de esa estructura lo que determina la actividad biológica de una proteína. En el caso de Spike, las principales actividades biológicas son unirse a un receptor en la superficie celular y permitir la fusión de las membranas de la célula y del virión, lo que conduce a la entrada del ARN viral en la célula.

La secuencia de aminoácidos de una proteína viene determinada por la secuencia del ARNm que la codifica. Esta cadena de aminoácidos es producida por una maquinaria especializada de nuestras células, el ribosoma, que traduce la información genética contenida en la secuencia de nucleótidos del ARNm en una secuencia de aminoácidos.

En una secuencia de ARNm hay cuatro nucleótidos, A, C, G y U, y en las proteínas hay 20 aminoácidos. ¿Cómo se pasa de 4 nucleótidos a 20 aminoácidos? Se entra en el código genético, dilucidado a principios de los años sesenta. Una secuencia de ARNm se lee en tripletes de nucleótidos, llamados codones. Como las 3 posiciones de un triplete pueden ser cualquiera de los 4 nucleótidos, hay 4 x 4 x 4 codones posibles, es decir, 64 codones en total.

=

Existe cierta degeneración en el código genético; un aminoácido dado puede estar codificado por 1, 2, 3, 4 ó 6 codones. Por ejemplo, el aminoácido glicina puede codificarse con estos cuatro codones: GGA, GGC, GGG y GGU, lo que nos lleva a un concepto clave, las mutaciones sinónimas y no sinónimas. Las secuencias genéticas varían de forma natural con el tiempo, cambian nucleótidos específicos o se suprimen o insertan, lo que se denomina mutaciones con respecto a la secuencia original. Los virus de ARN, en particular, son propensos a mutaciones rápidas.

Cuando el tercer nucleótido de un triplete que codifica la glicina se sustituye por cualquier otro nucleótido, el aminoácido codificado seguirá siendo la glicina, lo que se denomina una mutación sinónima. En cambio, si se modifica cualquiera de los dos primeros nucleótidos, el aminoácido producido será otro, por lo que se trata de una mutación no sinónima. Dado el código genético, algo menos de una cuarta parte de las mutaciones aleatorias serán sinónimas.

Cuando una mutación es sinónima, el aminoácido no cambia y, por tanto, la actividad de la proteína no se ve afectada. En el caso de las mutaciones no sinónimas, el efecto del aminoácido modificado puede ser desfavorable, neutro o favorable para la función de la proteína. La mayoría de las mutaciones no sinónimas afectan negativamente a la función de una proteína, porque una secuencia proteica ya es el producto de una larga evolución seleccionando aminoácidos favorables.

En el caso de un virus, las mutaciones desfavorables están en desventaja y se eliminan rápidamente, es la selección negativa, mientras que las mutaciones favorables tienen una ventaja competitiva sobre las mutaciones no sinónimas o neutras. Por ejemplo, las mutaciones que aumentan la afinidad de Spike por su receptor celular son favorables y se seleccionan positivamente. Después de esta introducción a la biología molecular básica, estamos en condiciones de comprender los datos presentados por los investigadores japoneses.

Examinaron 3 linajes de Omicron, BA.1, BA1.1 y BA.2. En comparación con la cepa original de Wuhan, BA.1 presenta 50 cambios de aminoácidos, 39 de los cuales se encontraron en Spike, que es una proteína de 1.273 aminoácidos de longitud, de los 14.149 aminoácidos codificados por el virus. Se espera que se encuentren más mutaciones en Spike en comparación con el resto del genoma, debido a las restricciones contra el cambio para mantener la función para la maquinaria de replicación (11.501 aminoácidos) y la presión selectiva sobre Spike para interactuar mejor con su receptor.

Omicron BA.2, identificado menos de 2 semanas después de BA.1, tiene 31 aminoácidos cambiados en comparación con la cepa Wuhan en Spike, 14 de los cuales son compartidos con BA.1. Curiosamente, estas secuencias tempranas de Omega Spike tienen una sola mutación sinónima y 39 o 31 mutaciones no sinónimas para los linajes BA.1 y BA.2, respectivamente. Esta proporción de mutaciones sinónimas y no sinónimas es claramente anormal, ya que se espera que el ~24% de las mutaciones aleatorias sean sinónimas y generalmente no hay presión selectiva a favor o en contra de la mutación sinónima.

Por el contrario, los descendientes inmediatos de BA.1, como BA.1.1, BA.1-0.1 y BA.1-0.2 tienen 23 mutaciones sinónimas y BA.2-01, el descendiente inmediato de BA.2, tiene 21 mutaciones sinónimas, pero ninguna nueva mutación no sinónima. Se sabe que las mutaciones sinónimas se acumulan regularmente a lo largo del tiempo, proporcionando una especie de reloj evolutivo, mientras que la acumulación de mutaciones no sinónimas está en función de su beneficio para la replicación del virus.

Los linajes BA.1 y BA.2 deben compartir un ancestro común dadas sus 14 mutaciones no sinónimas idénticas y una mutación sinónima en Spike, y desde el momento de su divergencia deben haber transcurrido muchos meses para acumular 25 o 17 mutaciones no sinónimas adicionales, respectivamente. Sin embargo, durante ese tiempo, unos 8-10 meses, no se produjo ni una sola mutación sinónima en ninguno de los dos linajes, lo que es claramente incompatible con la evolución natural y con la observación de que sus descendientes inmediatos albergaban más de veinte mutaciones sinónimas en su secuencia de Spike.

=

¿Qué ocurre con las variantes anteriores? En comparación con la cepa original de Wuhan la variante Alpha tenía 10 mutaciones no sinónimas en Spike, Beta tenía 10, Gamma tenía 12, Delta tenía 11 y Mu tenía 9, pero sorprendentemente ninguna de estas variantes tenía ninguna mutación sinónima en Spike. Estas observaciones no tienen precedentes en la historia de la evolución natural de los genomas virales.

De vuelta a los linajes Omicron, los investigadores sondearon las bases de datos en busca de los precursores inmediatos de BA.1 y BA.2. Para ello empezaron por revertir uno de cada aminoácido modificado al original en la secuencia de Wuhan y utilizaron un programa de alineación para encontrar coincidencias perfectas en las bases de datos. Según la teoría evolutiva cabría esperar encontrar variantes en las que uno, dos, tres y más de los aminoácidos cambiados correspondieran a la secuencia original de Wuhan.

Ese retroceso en el árbol evolutivo identificaría el camino seguido desde el ancestro común hasta BA.1 y BA.2, acumulando progresivamente cambios adicionales en su secuencia de aminoácidos, pero no fue eso lo que observaron. Sorprendentemente encontraron un 100% de coincidencias para 38 de los 39 aminoácidos invertidos individuales del linaje BA.1. Del mismo modo, hallaron coincidencias perfectas para 29 de las 31 reversiones encontradas en el linaje BA.2.

Estos resultados no podrían ser más incompatibles con la teoría evolutiva, donde se espera la acumulación progresiva de cambios en las secuencias de aminoácidos y no lo que se observa aquí, que es 38 y 29 candidatos como precursores inmediatos de los linajes BA.1 y BA.2, respectivamente.

Es posible que algunas de estas secuencias sean lo que se conoce como revertantes naturales [un gen, individuo o cepa mutante que recupera una capacidad anterior (como la producción de una proteína concreta) al sufrir una nueva mutación], en las que una nueva mutación devuelve el aminoácido mutado a su identidad original. Sin embargo, para detectar todos estos raros casos de reversión sería necesario sondear un número astronómico de secuencias y el limitado número de secuencias presentes en las bases de datos excluye esa posibilidad.

Entonces ¿cómo explicar estas observaciones? Un biólogo molecular reconocerá este patrón de mutantes como el de un experimento clásico en el que se analiza sistemáticamente el efecto de mutaciones específicas, una por una. Las hipótesis alternativas, basadas en la evolución natural, no vienen a la mente.

La hipótesis más parsimoniosa para dar cuenta de las observaciones comunicadas por Tanaka y Miyazawa es que las BA.1 y BA.2 del linaje Omicron, así como todas sus revertantes de un solo aminoácido encontradas en las bases de datos, son productos de laboratorio específicamente diseñados y generados.

Además, el desequilibrio extremadamente anormal entre mutaciones sinónimas y no sinónimas encontrado en los linajes Omicron BA.1 y BA.2 también se encuentra en las variantes Alpha, Beta, Gamma, Delta y Mu, que tienen cada una unas 10 mutaciones no sinónimas pero cero cambios sinónimos en la secuencia de nucleótidos. Dado que la probabilidad de un patrón de mutación de este tipo es extremadamente baja, es difícil escapar a la conclusión de que lo más probable es que estas variantes también sean creaciones de laboratorio.

Las implicaciones de estos hallazgos sobre el origen del SARS-CoV-2 serán sin duda profundamente inquietantes.


No hay comentarios: